Atualizar dados de saúde

Depois da importação inicial de dados para o repositório de dados de saúde da Vertex AI para Pesquisa, você pode ter feito uma das seguintes atualizações no repositório FHIR de origem:

  • Adição de novos recursos FHIR
  • Recursos FHIR atualizados
  • Recursos FHIR excluídos

Nesses casos, é possível reconciliar as mudanças do repositório FHIR de origem com o repositório de dados de saúde da Vertex AI para Pesquisa.

Visão geral da reconciliação

É possível conciliar as mudanças de forma incremental ou completa. Os dois modos são comparados na tabela a seguir.

Mudanças no armazenamento de FHIR de origem Modo incremental Modo completo
Novos recursos do FHIR Adiciona novos documentos ao repositório de dados da Vertex AI para Pesquisa. Adiciona novos documentos ao repositório de dados da Vertex AI para Pesquisa.
Recursos FHIR atualizados Substitui os documentos atuais no repositório de dados da Vertex AI para Pesquisa, mantendo o ID do documento. Substitui os documentos atuais no repositório de dados da Vertex AI para Pesquisa, mantendo o ID do documento.
Recursos FHIR excluídos Não reconciliado Remove os documentos correspondentes do seu repositório de dados da Vertex AI para Pesquisa

Antes de começar

Revise as cotas e os limites do seu projeto Google Cloud . O repositório de dados de saúde da Vertex AI para Pesquisa pode conter no máximo 1 milhão de documentos por projeto. Se essa cota for atingida durante a importação, o processo será interrompido.

Fazer uma importação incremental

O exemplo a seguir mostra como importar mudanças incrementais de um armazenamento FHIR da API Cloud Healthcare usando o método documents.import.

REST

  1. Faça uma importação incremental.

    curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-H "X-Goog-User-Project: PROJECT_ID" \
"https://us-discoveryengine.googleapis.com/v1alpha/projects/PROJECT_ID/locations/us/dataStores/DATA_STORE_ID/branches/0/documents:import" \
-d '{
   "reconciliation_mode": "INCREMENTAL",
   "fhir_store_source": {"fhir_store": "projects/PROJECT_ID/locations/CLOUD_HEALTHCARE_DATASET_LOCATION/datasets/CLOUD_HEALTHCARE_DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID"}
}'

    Substitua:

    • PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto.
    • DATA_STORE_ID: o ID do repositório de dados da Vertex AI para Pesquisa.
    • CLOUD_HEALTHCARE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados da API Cloud Healthcare que contém o armazenamento FHIR de origem.
    • CLOUD_HEALTHCARE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados da API Cloud Healthcare que contém o armazenamento FHIR de origem.
    • FHIR_STORE_ID: o ID do armazenamento FHIR R4 da API Cloud Healthcare.

  2. Verifique se a operação de importação de dados FHIR foi concluída.

    curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://us-discoveryengine.googleapis.com/v1alpha/projects/PROJECT_ID/locations/us/collections/default_collection/dataStores/DATA_STORE_ID/branches/0/operations/IMPORT_OPERATION_ID"

    Substitua:

    • PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto.
    • DATA_STORE_ID: o ID do repositório de dados da Vertex AI para Pesquisa.
    • IMPORT_OPERATION_ID: o ID da operação de longa duração retornado quando você chama o método import.

Python

Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Python de aplicativos de IA.

Para autenticar no AI Applications, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local. 

from google.api_core.client_options import ClientOptions
from google.cloud import discoveryengine

# TODO(developer): Uncomment these variables before running the sample.
# project_id = "YOUR_PROJECT_ID"
# location = "YOUR_LOCATION" # Values: "us"
# data_store_id = "YOUR_DATA_STORE_ID"
# healthcare_project_id = "YOUR_HEALTHCARE_PROJECT_ID"
# healthcare_location = "YOUR_HEALTHCARE_LOCATION"
# healthcare_dataset_id = "YOUR_HEALTHCARE_DATASET_ID"
# healthcare_fihr_store_id = "YOUR_HEALTHCARE_FHIR_STORE_ID"

#  For more information, refer to:
# https://cloud.google.com/generative-ai-app-builder/docs/locations#specify_a_multi-region_for_your_data_store
client_options = (
    ClientOptions(api_endpoint=f"{location}-discoveryengine.googleapis.com")
    if location != "global"
    else None
)

# Create a client
client = discoveryengine.DocumentServiceClient(client_options=client_options)

# The full resource name of the search engine branch.
# e.g. projects/{project}/locations/{location}/dataStores/{data_store_id}/branches/{branch}
parent = client.branch_path(
    project=project_id,
    location=location,
    data_store=data_store_id,
    branch="default_branch",
)

request = discoveryengine.ImportDocumentsRequest(
    parent=parent,
    fhir_store_source=discoveryengine.FhirStoreSource(
        fhir_store=client.fhir_store_path(
            healthcare_project_id,
            healthcare_location,
            healthcare_dataset_id,
            healthcare_fihr_store_id,
        ),
    ),
    # Options: `FULL`, `INCREMENTAL`
    reconciliation_mode=discoveryengine.ImportDocumentsRequest.ReconciliationMode.INCREMENTAL,
)

# Make the request
operation = client.import_documents(request=request)

print(f"Waiting for operation to complete: {operation.operation.name}")
response = operation.result()

# After the operation is complete,
# get information from operation metadata
metadata = discoveryengine.ImportDocumentsMetadata(operation.metadata)

# Handle the response
print(response)
print(metadata)