本页面介绍了如何使用 Pub/Sub 获取有关 DICOM 存储区中临床事件的通知。当新的 DICOM 实例存储在 DICOM 存储区中或从 Cloud Storage 导入时,您可以接收 Pub/Sub 通知。
您可以使用 Pub/Sub 通知来实现多种用途,例如触发下游处理或分析新数据。例如,当有新数据可用于训练时,机器学习模型可以接收通知,并生成数据洞见来改善患者护理。
下图显示了 Pub/Sub 通知的生成和发布方式。
图 1. 接收有关 DICOM 存储区中临床事件的 Pub/Sub 通知。
图 1 显示了以下步骤:
- 调用方发出存储或导入 DICOM 实例的请求。
- DICOM 存储区接收请求,创建 Pub/Sub 消息,然后将其发送到 DICOM 存储区上配置的 Pub/Sub 主题。
- Pub/Sub 将消息转发给附加到主题的订阅。
- 订阅者会收到来自订阅的消息。每个订阅可以有一个或多个订阅者(提高并行性)。
准备工作
添加 Pub/Sub 发布商权限
如需将消息从 Cloud Healthcare API 发布到 Pub/Sub,您必须将 pubsub.publisher
角色添加到项目的 Cloud Healthcare Service Agent 服务账号。如需了解详情,请参阅 DICOM、FHIR 和 HL7v2 存储区 Pub/Sub 权限。
通知格式和内容
Pub/Sub 通知包含一个 Message
对象,其中包含有关临床事件的信息。Message
对象类似于以下内容:
{ "message": { "attributes": { "action": "ACTION", "lastUpdatedTime": "RFC_1123_FORMAT_DATETIME", "storeName": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID", "studyInstanceUID": "STUDY_UID", "seriesInstanceUID": "SERIES_UID", "sopInstanceUID": "INSTANCE_UID", "versionId": "VERSION_ID", "modality": "MODALITY", "storageClass": "STORAGE_CLASS", "previousStorageClass": "PREVIOUS_STORAGE_CLASS" }, "data": "BASE_64_ENCODED_DATA", "messageId": "MESSAGE_ID", "publishTime": "YYYY-MM-DDTHH:MM:SS+ZZ:ZZ" } }
如需详细了解每条 Pub/Sub 消息中包含的字段,请参阅 ReceivedMessage
和 PubsubMessage
。
下表介绍了 attributes
对象中的每个字段:
属性 | 说明 | 示例 |
---|---|---|
action |
DICOM 资源上发生的操作。可能的值包括:
|
StoreInstances |
lastUpdatedTime |
DICOM 资源最近一次修改的时间戳。时间戳采用 RFC 1123 格式。 | Mon, 01 Jan 2020 00:00:00 UTC |
storeName |
发生操作的 DICOM 存储区的完整资源名称。 | projects/my-project/locations/us/datasets/my-dataset/dicomStores/my-dicom-store |
studyInstanceUID |
DICOM 研究实例唯一标识符 (UID)。 | 1.2.3.4.5.6 |
seriesInstanceUID |
DICOM 系列实例唯一标识符 (UID)。 | 1.2.3.4.5.6 |
sopInstanceUID |
DICOM SOP 实例唯一标识符 (UID)。 | 1.2.3.4.5.6 |
versionId |
发生相应操作的 DICOM 资源的最新版本的 ID。 | MTY4MzA2MDQzOTI5NjIxMDAwMA |
modality |
相应 DICOM 资源的模态标记。可能的值包括但不限于:
|
CT |
storageClass |
DICOM 资源的存储类别。可能的值包括:
|
STANDARD |
previousStorageClass |
相应 DICOM 资源之前的存储类别。可能的值包括:
|
NEARLINE |
下表介绍了 message
对象中的其余字段:
字段 | 说明 |
---|---|
data |
以下标识符的 base64 编码字符串:projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_UID/series/SERIES_UID/instances/INSTANCE_UID |
messageId |
Pub/Sub 消息的标识符。 |
publishTime |
Pub/Sub 服务器发布消息的时间。 |
配置和查看通知
本部分介绍了如何对 DICOM 存储区启用 Pub/Sub 通知、存储或导入 DICOM 实例以发布通知,以及查看通知。
配置 DICOM 存储区
以下示例展示了如何在 DICOM 存储区中启用 Pub/Sub 通知,以便在存储或从 Cloud Storage 导入新的 DICOM 实例时收到通知。
REST
使用 projects.locations.datasets.dicomStores.patch
方法。
NotificationConfig.sendForBulkImport
的值为 true
,因此在从 Cloud Storage 导入数据时会发送通知。
在使用任何请求数据之前,请先进行以下替换:
PROJECT_ID
:您的 Google Cloud 项目的 IDLOCATION
:数据集位置DATASET_ID
:DICOM 存储区的父数据集DICOM_STORE_ID
:DICOM 存储区 IDPUBSUB_TOPIC
:当数据存储区中发生事件时,消息发布到的 Pub/Sub 主题
请求 JSON 正文:
{ "notificationConfig": { "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC", "sendForBulkImport": "true" } }
如需发送请求,请选择以下方式之一:
curl
将请求正文保存在名为 request.json
的文件中。在终端中运行以下命令,在当前目录中创建或覆盖此文件:
cat > request.json << 'EOF' { "notificationConfig": { "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC", "sendForBulkImport": "true" } } EOF
然后,执行以下命令以发送 REST 请求:
curl -X PATCH \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID?updateMask=notificationConfig"
PowerShell
将请求正文保存在名为 request.json
的文件中。在终端中运行以下命令,在当前目录中创建或覆盖此文件:
@' { "notificationConfig": { "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC", "sendForBulkImport": "true" } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
然后,执行以下命令以发送 REST 请求:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method PATCH `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID?updateMask=notificationConfig" | Select-Object -Expand Content
API Explorer
复制请求正文并打开方法参考页面。APIs Explorer 面板会在页面右侧打开。您可以与此工具进行交互以发送请求。 将请求正文粘贴到此工具中,填写任何其他必填字段,然后点击执行。
您应该会收到类似如下所示的响应。
如果您在 DicomStore
资源中配置了任何字段,它们也会出现在响应中。
gcloud
运行 gcloud healthcare dicom-stores update
命令。
在使用下面的命令数据之前,请先进行以下替换:
PROJECT_ID
:您的 Google Cloud 项目的 IDLOCATION
:数据集位置DATASET_ID
:DICOM 存储区的父数据集DICOM_STORE_ID
:DICOM 存储区 IDPUBSUB_TOPIC
:当数据存储区中发生事件时,消息发布到的 Pub/Sub 主题
执行以下命令:
Linux、macOS 或 Cloud Shell
gcloud healthcare dicom-stores update DICOM_STORE_ID \ --dataset=DATASET_ID \ --location=LOCATION \ --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC \ --send-for-bulk-import
Windows (PowerShell)
gcloud healthcare dicom-stores update DICOM_STORE_ID ` --dataset=DATASET_ID ` --location=LOCATION ` --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC ` --send-for-bulk-import
Windows (cmd.exe)
gcloud healthcare dicom-stores update DICOM_STORE_ID ^ --dataset=DATASET_ID ^ --location=LOCATION ^ --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC ^ --send-for-bulk-import
您应该会收到类似如下所示的响应:
响应
Updated dicomStore [DICOM_STORE_ID]. ... name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID notificationConfig: pubsubTopic: projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC sendForBulkImport: true
存储或导入 DICOM 实例,并查看 Pub/Sub 通知
如需存储或导入 DICOM 实例并拉取生成的 Pub/Sub 消息,请完成以下步骤:
存储或导入 DICOM 实例。该请求会导致 Cloud Healthcare API 向配置的 Pub/Sub 主题发布消息。
撤回消息。如果您在单个请求中导入多个 DICOM 实例,系统会为每个 DICOM 实例生成一条消息。
如需查看拉取 Pub/Sub 消息所需的 Identity and Access Management 权限,请参阅 Pub/Sub 访问权限控制。
REST
使用
projects.subscriptions.pull
方法。 以下示例使用?maxMessages=10
查询参数来指定请求中要返回的最大消息数。根据您的用例调整此值。在使用任何请求数据之前,请先进行以下替换:
PROJECT_ID
:您的 Google Cloud 项目的 IDPUBSUB_SUBSCRIPTION_ID
:附加到 DICOM 存储区上配置的 Pub/Sub 主题的订阅的 ID
如需发送请求,请选择以下方式之一:
curl
执行以下命令:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d "" \
"https://pubsub.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/subscriptions/PUBSUB_SUBSCRIPTION_ID:pull?maxMessages=10"PowerShell
执行以下命令:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-Uri "https://pubsub.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/subscriptions/PUBSUB_SUBSCRIPTION_ID:pull?maxMessages=10" | Select-Object -Expand ContentAPI Explorer
打开方法参考页面。APIs Explorer 面板会在页面右侧打开。您可以与此工具进行交互以发送请求。 填写所有必填字段,然后点击执行。
您应该收到类似以下内容的 JSON 响应:
gcloud
运行
gcloud pubsub subscriptions pull
命令。此示例使用了以下 Google Cloud CLI 标志:
--limit=10
:最多返回 10 条消息。根据您的用例调整此值。--format=json
:以 JSON 格式呈现输出。--auto-ack
:自动确认拉取的每条消息。
在使用下面的命令数据之前,请先进行以下替换:
PROJECT_ID
:您的 Google Cloud 项目的 IDPUBSUB_SUBSCRIPTION_ID
:附加到 DICOM 存储区上配置的 Pub/Sub 主题的订阅的 ID
执行以下命令:
Linux、macOS 或 Cloud Shell
gcloud pubsub subscriptions pull \ projects/PROJECT_ID/subscriptions/PUBSUB_SUBSCRIPTION_ID \ --limit=10 \ --auto-ack \ --format=json
Windows (PowerShell)
gcloud pubsub subscriptions pull ` projects/PROJECT_ID/subscriptions/PUBSUB_SUBSCRIPTION_ID ` --limit=10 ` --auto-ack ` --format=json
Windows (cmd.exe)
gcloud pubsub subscriptions pull ^ projects/PROJECT_ID/subscriptions/PUBSUB_SUBSCRIPTION_ID ^ --limit=10 ^ --auto-ack ^ --format=json
您应该会收到类似如下所示的响应:
[ { "ackId": "RFAGFixdRkhRNxkIaFEOT14jPzUgKEUaAggUBXx9cEFLdVhUcGhRDRlyfWB9bQ5GAgpGWixfURsHaE5tdR", "ackStatus": "SUCCESS", "message": { "attributes": { "action": "ImportDicomData", "lastUpdatedTime": "YYYY-MM-DDTHH:MM:SS+ZZ:ZZ", "storeName": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID", "studyInstanceUID": "1.3.6.1.4.1.1129.5.111396399361969898205364400549799252857604", "seriesInstanceUID": "1.3.6.1.4.1.1129.5.111396399361969898205364400549799252857605", "sopInstanceUID": "1.3.6.1.4.1.1129.5.111396399361969898205364400549799252857606", "versionId": "MTY4MzA2MDQzOTI5NjIxMDAwMA", "modality": "CT", "storageClass": "STANDARD", }, "data": "cHJvamVjdHMvbXlwcm9qZWN0L2xvY2F0aW9ucy91cy1jZW50cmFsMS9kYXRhc2V0cy9teS1kYXRhc2V0L2RpY29tU3RvcmVzL215LWRpY29tLXN0b3JlL2RpY29tV2ViL3N0dWRpZXMvMS4zLjYuMS40LjEuMTExMjkuNS41LjExMTM5NjM5OTM2MTk2OTg5ODIwNTM2NDQwMDU0OTc5OTI1Mjg1NzYwNC9zZXJpZXMvMS4zLjYuMS40LjEuMTExMjkuNS41LjE5NTYyODIxMzY5NDMwMDQ5ODk0Njc2MDc2NzQ4MTI5MTI2MzUxMTcyNC9pbnN0YW5jZXMvMS4zLjYuMS40LjEuMTExMjkuNS41LjE1Mzc1MTAwOTgzNTEwNzYxNDY2NjgzNDU2MzI5NDY4NDMzOTc0NjQ4MA==", "messageId": "7586159156345265", "publishTime": "YYYY-MM-DDTHH:MM:SS+ZZ:ZZ" } } ]
Cloud Healthcare API 和 Pub/Sub 消息存储政策
为确保 Cloud Healthcare API 数据与 Pub/Sub 消息中的关联数据位于同一区域,您必须设置 Pub/Sub 消息存储政策。
您必须为数据存储区中配置的 Pub/Sub 主题明确设置消息存储政策,才能确保数据保留在同一区域中。例如,如果 Cloud Healthcare API 数据集和 FHIR 存储区位于 us-central1
,则消息存储政策必须仅允许 us-central1
区域。
如需配置消息存储政策,请参阅配置消息存储政策。
排查遗漏的 Pub/Sub 消息问题
如果无法将通知发布到 Pub/Sub,则 Cloud Logging 会记录错误。如需了解详情,请参阅在 Cloud Logging 中查看错误日志。
如果错误生成率超过限制,则超出此限制的错误不会提交到 Cloud Logging。